Sinusuri ang neuroimaging sa Linux. Ang Lin4Neuro ay isang mahusay na paraan upang makapagsimula

Sinusuri ang Neuroimages sa Linux

Maraming mga gumagamit ng Linux ang nahuhumaling sa makamit ang pamumuno sa desk. Para sa kanila hindi ito tungkol sa pagkalat ng libreng software at ang 4 na kalayaan ngunit upang talunin ang Microsoft. Ang katotohanan na ang merkado para sa mga personal na computer ay umakyat, at ang mga pagkilos ng Google at Apple sa mga mobile phone ay mas mapanganib kaysa sa Microsoft sa kanilang pinakamahusay na (pinakamasamang) araw, tila wala silang pakialam.

Hindi rin nila nasisiyahan nakamit ang pamumuno sa mga partikular na niches tulad ng cloud, web server o mga supercomputer. Mas gusto nilang mag-aksaya ng oras sa mga sterile na talakayan sa mga tagahanga ng Photoshop o Excel.

Ito ang dahilan kung bakit ang aking resolusyon sa Bagong Taon ay kilalanin ang mga libreng tool ng software na maaaring magamit nang may malaking tagumpay sa mga sektor kung saan karamihan sa atin na nagsusulat sa paksa ay hindi karaniwang napapansin.

Sa post na ito ay pag-uusapan natin lin4neuroIsang pamamahagi na dapat isaalang-alang ng mga interesado sa imaging ng utak ng tao.

Walang alinlangan, isinasaalang-alang kung ano ang ginugugol ng mga pamahalaan at pribadong mamamayan sa kalusugan, ang anumang pag-save sa gastos ng mga lisensya nang walang pagkawala sa kalidad ng pangangalaga ay isang karapat-dapat na layunin na makamit. Ito ay isang sektor kung saan ang libre at bukas na mapagkukunan ng software ay maraming maibibigay.

Sinusuri ang neuroimaging sa Linux. Ang isang mahusay na panimulang punto para sa mga mag-aaral at propesyonal

Ito ay isang bersyon na nagmula sa Ubuntu na ginawa ng isang propesor sa unibersidad ng Tsukuba sa Japan. Ito ay batay sa Ubuntu 16.04 at tila hindi na-update mula noong 2017. Gayunpaman, bumubuo pa rin ito isang magandang panimulang punto para sa mga neuroimaging na propesyonal upang maging pamilyar sa mga bukas na application ng mapagkukunan at ang mga mag-aaral ay gumagawa ng praktikal na gawain.

Ang pinag-aralan na mga imahe maibabahagi madali

Sa listahan ng mga programa isinasama ko ang mga link sa kani-kanilang mga pahina hangga't maaari.

Mangyaring tandaan na hindi ako doktor. Bagaman sa tulong ng Google sinubukan kong gawing wasto ang mga pagsasalin hangga't maaari, maaaring napaloko ako. Na-appreciate ko na ang anumang pagwawasto.

Kabilang sa mga application na kasama sa pamamahagi maaari naming banggitin:

3D slicer: Ang app na ito Nagsasama ito ng mga algorithm para sa pagtatasa ng mga imaheng nakuha sa pamamagitan ng pagganap ng magnetic resonance imaging at ng diffuse tenor. Maaari din silang magamit para sa therapy na may gabay sa imahe.

AFNI:  Programa para sa pagproseso at pagtatasa ng data na nakuha mula sa mga imaheng magnetic resonance.

UCL Way Diffusion MRI Toolki: Ilalagay ko ang paglalarawan sa Ingles upang hindi makulit. Para sa pagpoproseso ng pagsasabog ng MRI. Nabibigyan ko ng kahulugan ito para sa pagsasabog ng magnetic resonance imaging analysis. Kung mayroong isang dalubhasa sa imaging sa silid na maaaring linawin ang isyu para sa amin, sa ibaba ay ang form ng komento. Link

caret: Ang app na ito  Pinapayagan ang gumagamit na lumikha, tingnan at manipulahin ang mga reconstruction ng mga ibabaw ng utak at cerebral cortex.

Connectome Analyzer: Ang pagtatasa ng mga koneksyon sa pagitan ng mga mapagkukunan mula sa anumang pinagmulan (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, atbp.) Sa iba't ibang mga antas (pandaigdigan, mga subnet at lokal).

Connectome Viewer: nagkokonekta sa multimodal at multiscale neuroimaging at mga hanay ng data ng network para sa pagtatasa at paggunita sa Python.

FSL: Pagsusuri sa imahe at mga tool sa istatistika para sa data ng imaging utak ng fMRI, MRI, at DTI. Link

Ginkgo CADx: Ang application na ito ay isang mga manonood ng larawan nai-save sa ilalim ng pamantayan ng DICOM.

ITK-Snap: Programa para sa paghihiwalay ng mga istraktura sa mga 3D na imaheng medikal. Link

Toolkit ng minc: Application para sa paghawak ng mga file ng MINC

MITK: Mga tool para sa pagpapaunlad ng interactive na software para sa pagproseso ng medikal na imahe.

MITK Pagkakalat: Ang programa  nagsasama ng isang pagpipilian ng mga algorithm sa pagtatasa ng imahe para sa diffusion-weighted magnetic resonance imaging.

MRIConvert: Es isang utility medikal na file converter ng imahe na nagko-convert ng mga file ng DICOM sa NIfTI 1.1, Pag-aralan ang 7.5, SPM99 / Pag-aralan, mga format ng dami ng BrainVoyager at MetaImage.

MRIcron: Ay isang kasangkapan ng visualization at pagtatasa ng mga imahe na nakuha ng magnetic resonance (functional).

si mrtrix: Ay isang set ng mga tool upang maisagawa ang puting bagay na tractography sa diffusion-weighted magnetic resonance imaging sa isang matatag na pamamaraan upang tumawid sa mga hibla, gamit ang pinaghihigpitan spherical deconvolution (CSD) at mga probabilistic streamline.

Virtual NMR: Gumagawa ng isang makatotohanang simulation ng isang MRI scanner.


Iwanan ang iyong puna

Ang iyong email address ay hindi nai-publish. Mga kinakailangang patlang ay minarkahan ng *

*

*

  1. Responsable para sa data: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Layunin ng data: Kontrolin ang SPAM, pamamahala ng komento.
  3. Legitimation: Ang iyong pahintulot
  4. Komunikasyon ng data: Ang data ay hindi maiparating sa mga third party maliban sa ligal na obligasyon.
  5. Imbakan ng data: Ang database na naka-host ng Occentus Networks (EU)
  6. Mga Karapatan: Sa anumang oras maaari mong limitahan, mabawi at tanggalin ang iyong impormasyon.

  1.   Nasher_87 (ARG) dijo

    Napakahusay, may mga oras na bibigyan ka nila ng mga imaheng medikal at maaari mo lamang itong buksan sa darating na programa / manonood, hindi sinasadya, sa Windows lamang. Nakita ko ang DICOM ng maraming beses, hindi ko sila mabuksan
    «Para sa pagpoproseso ng pagsasabog ng MRI» Hindi ako isang doktor, ngunit naiintindihan ko na ito ay mga imahe ng taginting na may kaibahan (pagkuha ng likido)

    1.    Diego German na si Gonzalez dijo

      Salamat sa paglinaw.