使用Linux分析神經影像。 Lin4Neuro是入門的好方法

使用Linux分析Neuroimages

許多Linux用戶沉迷於 在辦公桌前發揮領導作用。 對他們而言,這與傳播自由軟件及其四大自由無關,而是 擊敗微軟。 他們似乎並不在意個人計算機市場已經達到頂峰,而且谷歌和蘋果在手機上採取的行動在微軟最好(最糟糕)的日子比微軟的行動要危險得多。

他們也無法享受 在特定領域取得領導地位 例如雲,Web服務器或 超級計算機。 他們傾向於浪費時間與Photoshop或Excel的愛好者進行無菌討論。

這就是為什麼我的新年決議是 知名的免費軟件工具可以成功使用 在我們大多數人都對此主題不甚關注的領域中。

在這篇文章中,我們將討論 林4神經對人腦成像感興趣的人應該考慮的分佈。

毫無疑問,考慮到政府和公民在健康上的花費,在不降低醫療質量的前提下節省執照費用是值得實現的目標。 在這個領域,免費和開放源代碼軟件可以提供很多幫助。

使用Linux分析神經影像。 對於學生和專業人士來說是一個很好的起點

它是由日本筑波大學的教授製作的Ubuntu的衍生版本。 它基於Ubuntu 16.04,自2017年以來似乎未進行更新。但是,它仍然構成 對於神經影像專業人士來說是一個很好的起點 熟悉開源應用程序,並讓學生從事實際工作。

分析的圖像 可以分享 容易。

在程序列表中,我盡可能包含指向其相應頁面的鏈接。

請注意,我不是醫生。 儘管在Google的幫助下,我試圖使翻譯盡可能正確,但我可能會搞砸了。 我已經感謝任何糾正。

在發行版中包含的應用程序中,我們可以提到:

3D切片器: 這個應用程序 它包括用於分析通過功能磁共振成像和擴散張量獲得的圖像的算法。 它們也可以用於圖像引導療法。

AFNI:  程序 用於處理和分析從磁共振圖像獲得的數據。

UCL Camino擴散MRI Toolki: 我將用英語寫描述,以免搞砸。 用於擴散MRI處理。 我將其解釋為用於彌散磁共振成像分析。 如果會議室中有影像專家可以為我們澄清問題,請在下面的評論表中進行。 鏈接

脫字號: 這個應用程序  允許用戶創建,查看和操縱大腦和大腦皮層表面的重建。

Connectome分析器: 分析來自任何來源(DSI,DTI,QBall,rs-fMRI等)的資源在不同規模(全局,子網和本地)之間的連接。

Connectome查看器: 連接多模態和多尺度神經影像和網絡數據集,以便在Python中進行分析和可視化。

FSL: 用於fMRI,MRI和DTI腦成像數據的圖像分析和統計工具。 鏈接

銀杏CADx:此應用程序是 圖片瀏覽器 按照DICOM標准保存。

ITK-Snap: 用於在3D醫學圖像中分割結構的程序。 鏈接

Minc工具包: 應用 用於處理MINC文件

MITK: 工具 用於開髮用於醫學圖像處理的交互式軟件。

MITK擴散: 該計劃  包括用於彌散加權磁共振成像的一系列圖像分析算法。

MRI轉換: Es 實用程序 醫學圖像文件轉換器,可將DICOM文件轉換為NIfTI 1.1,Analyze 7.5,SPM99 / Analyze,BrainVoyager和MetaImage卷格式。

MRIcron:是 一個工具 可視化和分析通過磁共振(功能)獲得的圖像。

特里克斯:是 一套 使用受限球面反褶積(CSD)和概率流線,以健壯的方式在彌散加權磁共振成像上執行白質tract的工具,以交叉纖維。

虛擬NMR: 產生MRI掃描儀的逼真模擬。


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  1.   Nasher_87(ARG) 他說:

    很好,有時候它們會為您提供醫學圖像,並且您只能使用附帶的程序/查看器打開它,僅在Windows中。 我幾次見過DICOM,我永遠都打不開
    «對於彌散MRI處理»我不是醫生,但我知道這是具有對比度(帶液體)的共振圖像

    1.    迭戈·德·岡薩雷斯(Diego German Gonzalez) 他說:

      感謝您的澄清。