使用Linux分析神经影像。 Lin4Neuro是入门的好方法

使用Linux分析神经影像

许多Linux用户着迷 在办公桌前发挥领导作用。 对他们而言,这与传播自由软件及其四大自由无关,而是 击败微软。 他们似乎并不在意个人计算机市场已经达到顶峰,而且谷歌和苹果在手机上采取的行动在微软最好(最糟糕)的日子比微软的行动要危险得多。

他们也无法享受 在特定领域取得领导地位 例如云,Web服务器或 超级计算机。 他们倾向于浪费时间与Photoshop或Excel的爱好者进行无菌讨论。

这就是为什么我的新年决议是 知名的免费软件工具可以成功使用 在我们大多数人写这个主题的领域通常都不会注意到。

在这篇文章中,我们将讨论 林4神经对人脑成像感兴趣的人应该考虑的分布。

毫无疑问,考虑到政府和公民在医疗上的花费,在不降低医疗质量的前提下节省执照费用是一个值得实现的目标。 在这个领域,免费和开放源代码软件可以提供很多帮助。

使用Linux分析神经影像。 对于学生和专业人士来说是一个很好的起点

它是日本筑波大学教授制作的Ubuntu的衍生版本。 它基于Ubuntu 16.04,自2017年以来似乎未进行更新。但是,它仍然构成 对于神经影像专业人士来说是一个很好的起点 熟悉开源应用程序,然后学生进行实际工作。

分析的图像 可以分享 轻松。

在程序列表中,我尽可能包含指向其相应页面的链接。

请注意,我不是医生。 尽管在Google的帮助下,我试图使翻译尽可能正确,但我可能已经搞砸了。 我已经感谢任何纠正。

在发行版中包含的应用程序中,我们可以提到:

3D切片器: 这个应用程序 它包括用于分析通过功能磁共振成像和扩散张量获得的图像的算法。 它们也可以用于图像引导疗法。

AFNI:  节目 用于处理和分析从磁共振图像获得的数据。

UCL Camino扩散MRI Toolki: 我将用英语来描述,以免搞砸。 用于扩散MRI处理。 我将其解释为用于弥散磁共振成像分析。 如果会议室中有影像专家可以为我们澄清问题,请在下面的评论表中进行。 链接

脱字号: 这个应用程序  允许用户创建,查看和操纵大脑和大脑皮层表面的重建。

Connectome分析仪: 分析来自任何来源(DSI,DTI,QBall,rs-fMRI等)的资源在不同规模(全局,子网和本地)之间的连接。

Connectome查看器: 连接多模态和多尺度神经影像和网络数据集,以便在Python中进行分析和可视化。

FSL: 用于fMRI,MRI和DTI脑成像数据的图像分析和统计工具。 链接

银杏CADx:此应用程序是 图片浏览器 按照DICOM标准保存。

ITK-Snap: 用于在3D医学图像中分割结构的程序。 链接

Minc工具包: 应用 用于处理MINC文件

MITK: 工具 用于开发用于医学图像处理的交互式软件。

MITK扩散: 该计划  包括用于弥散加权磁共振成像的一系列图像分析算法。

MRI转换: Es 实用程序 医学图像文件转换器,可将DICOM文件转换为NIfTI 1.1,Analyze 7.5,SPM99 / Analyze,BrainVoyager和MetaImage卷格式。

MRIcron:是 一个工具 可视化和分析通过磁共振(功能)获得的图像。

特里克斯:是 一套 使用受限球面反褶积(CSD)和概率流线,在弥散加权磁共振成像上稳固地穿过纤维进行白质tract成像的工具。

虚拟NMR: 产生MRI扫描仪的逼真模拟。


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  1.   Nasher_87(ARG)

    很好,有时候它们会为您提供医学图像,并且您只能使用附带的程序/查看器打开它,仅在Windows中。 我几次见过DICOM,我永远都打不开
    «对于弥散MRI处理»我不是医生,但是我知道这是具有对比度的共振图像(取液体)

    1.    迭戈·德·冈萨雷斯(Diego German Gonzalez)

      感谢您的澄清。