Linux ile nörogörüntülemeyi analiz ediyoruz. Lin4Neuro, başlamak için harika bir yoldur

Birçok Linux kullanıcısı, masada liderliğe ulaşmak. Onlar için özgür yazılımı ve onun 4 özgürlüğünü yaymakla ilgili değil, Microsoft'u yenmek. Kişisel bilgisayarlar pazarının zirveye ulaştığı ve Google ve Apple'ın cep telefonlarındaki eylemlerinin Microsoft'un en iyi (en kötü) günlerindeki eylemlerinden çok daha tehlikeli olduğu gerçeği umursamıyor gibi görünüyor.

Ne de zevk alamazlar belirli nişlerde elde edilen liderlik bulut, web sunucuları veya süper bilgisayarlar. Photoshop veya Excel hayranlarıyla steril tartışmalarda zaman kaybetmeyi tercih ediyorlar.

Bu nedenle Yeni Yıl kararım büyük bir başarı ile kullanılabilecek bilinen ücretsiz yazılım araçları yapmak konuyu yazanların çoğunun genellikle fark etmediği sektörlerde.

Bu yazıda hakkında konuşacağız lin4neuroİnsan beyni görüntülemeyle ilgilenenler tarafından dikkate alınması gereken bir dağılım.

Kuşkusuz, hükümetlerin ve özel vatandaşların sağlığa ne kadar harcadıkları hesaba katıldığında, bakım kalitesinde herhangi bir kayıp olmaksızın lisansların maliyetinde herhangi bir tasarruf, ulaşılmaya değer bir hedeftir. Özgür ve açık kaynak yazılımların vereceği çok şey olan bir sektördür.

Linux ile nörogörüntülemeyi analiz ediyoruz. Öğrenciler ve profesyoneller için harika bir başlangıç ​​noktası

Japon Tsukuba üniversitesinde bir profesör tarafından yapılan Ubuntu'nun türetilmiş bir versiyonudur. Ubuntu 16.04'e dayanıyor ve 2017'den beri güncellenmeyecek gibi görünüyor. nörogörüntüleme uzmanları için iyi bir başlangıç ​​noktası açık kaynak uygulamalarına aşina olur ve öğrenciler pratik işler yapar.

Analiz edilen görüntüler paylaşılabilir Kolayca.

Programlar listesine, mümkün olduğunda ilgili sayfalarının bağlantılarını ekliyorum.

Lütfen doktor olmadığımı unutmayın. Google'ın yardımıyla çevirileri olabildiğince doğru yapmaya çalışsam da, hata yapmış olabilirim. Herhangi bir düzeltmeyi şimdiden takdir ediyorum.

Dağıtıma dahil edilen uygulamalar arasında şunlar sayılabilir:

3D Dilimleyici: Bu uygulama Fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme ve difüzyon tensörü ile elde edilen görüntülerin analizi için algoritmalar içerir. Ayrıca görüntü rehberli terapi için de kullanılabilirler.

- AFNI:  Program manyetik rezonans görüntülerinden elde edilen verilerin işlenmesi ve analizi için.

UCL Camino Difüzyon MRI Toolki: Berbat etmemek için açıklamayı İngilizce yapacağım. Difüzyon MRI işleme için. Yaygın manyetik rezonans görüntüleme analizi için yorumluyorum. Odada bizim için sorunu netleştirebilecek bir görüntüleme uzmanı varsa aşağıdaki yorum formu bulunmaktadır. dolamak

İmleç: Bu uygulama  kullanıcının beyin ve serebral korteks yüzeylerinin rekonstrüksiyonlarını oluşturmasına, görüntülemesine ve manipüle etmesine izin verir.

Connectome Analizörü: Farklı ölçeklerde (global, alt ağlar ve yerel) herhangi bir kaynaktan (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, vb.) Gelen kaynaklar arasındaki bağlantıların analizi.

Connectome Görüntüleyici: Python'da analiz ve görselleştirme için çok modlu ve çok ölçekli nörogörüntüleme ve ağ veri setlerini birbirine bağlar.

FSL: FMRI, MRI ve DTI beyin görüntüleme verileri için görüntü analizi ve istatistiksel araçlar. dolamak

Ginkgo CADx: Bu uygulama bir resim görüntüleyici DICOM standardı altında kaydedilir.

ITK-Snap: 3B medikal görüntülerde yapıların segmentasyonu için program. dolamak

Minc araç seti: Uygulama MINC dosyalarını işlemek için

MİTK: Araçlar tıbbi görüntü işleme için etkileşimli yazılımın geliştirilmesi için.

MITK Difüzyonu: Program  difüzyon ağırlıklı manyetik rezonans görüntüleme için bir dizi görüntü analizi algoritmasını içerir.

MRIDönüştür: Es bir yardımcı program DICOM dosyalarını NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager ve MetaImage hacim formatlarına dönüştüren medikal görüntü dosyası dönüştürücü.

MRIcron: Bu bir araç manyetik rezonans (işlevsel) ile elde edilen görüntülerin görselleştirilmesi ve analizi.

mrtrix: Bu bir set kısıtlı küresel ters evrişim (CSD) ve olasılıklı akış çizgileri kullanarak, fiberleri çaprazlamak için sağlam bir şekilde difüzyon ağırlıklı manyetik rezonans görüntüleme üzerinde beyaz madde traktografisi gerçekleştirmek için araçlar.

Sanal NMR: Bir MRI tarayıcısının gerçekçi bir simülasyonunu üretir.