Analysera neuroimaging med Linux. Lin4Neuro är ett utmärkt sätt att komma igång

Analysera neurobilder med Linux

Många Linux-användare är besatta av uppnå ledarskap vid skrivbordet. För dem handlar det inte om att sprida fri programvara och dess fyra friheter utan för att besegra Microsoft. Det faktum att marknaden för persondatorer har nått sin topp och att Googles och Apples handlingar på mobiltelefoner är mycket farligare än Microsofts under sina bästa (värsta) dagar, de verkar inte bry sig.

De kan inte heller njuta ledarskap uppnås i specifika nischer som molnet, webbservrar eller superdatorer. De föredrar att slösa tid i sterila diskussioner med fans av Photoshop eller Excel.

Det är därför min nyårsupplösning är meddela gratis programvaruverktyg som kan användas med stor framgång inom sektorer där de flesta av oss som skriver om ämnet inte brukar märka det.

I det här inlägget ska vi prata om lin4neuroEn distribution som bör övervägas av dem som är intresserade av mänsklig hjärnavbildning.

Utan tvekan, med hänsyn till vad regeringar och privata medborgare spenderar på hälsa, är alla besparingar i licenskostnaderna utan förlust av vårdkvaliteten ett värdigt mål att uppnå. Det är en sektor där gratis och öppen källkod har mycket att ge.

Analysera neuroimaging med Linux. En bra utgångspunkt för studenter och yrkesverksamma

Det är en härledd version av Ubuntu gjord av en professor vid det japanska universitetet i Tsukuba. Den är baserad på Ubuntu 16.04 och verkar inte uppdateras sedan 2017. Den utgör dock fortfarande en bra utgångspunkt för neuroimaging-proffs bekanta dig med applikationer med öppen källkod och få eleverna att göra praktiskt arbete.

De analyserade bilderna kan delas lätt.

I programlistan inkluderar jag länkar till deras respektive sidor när det är möjligt.

Observera att jag inte är läkare. Även om jag med hjälp av Google försökte göra översättningarna så korrekta som möjligt, kan jag ha gjort det. Jag uppskattar redan någon korrigering.

Bland applikationerna som ingår i distributionen kan vi nämna:

3D-skärare: Denna ansökan Den innehåller algoritmer för analys av bilder erhållna med funktionell magnetisk resonansavbildning och genom diffusionstensor. De kan också användas för bildstyrd terapi.

AFNI:  Program för bearbetning och analys av data erhållna från magnetiska resonansbilder.

UCL Way Diffusion MRI Toolki: Jag ska lägga beskrivningen på engelska för att inte klara mig. För diffusions MR-bearbetning. Jag tolkar att det är för diffus magnetisk resonansbildningsanalys. Om det finns en bildspecialist i rummet som kan klargöra problemet för oss, finns kommentarformuläret nedan. Länk

Markör: Denna ansökan  låter användaren skapa, se och manipulera rekonstruktioner av ytor i hjärnan och hjärnbarken.

Connectome Analyzer: Analys av förbindelserna mellan resurser från valfri källa (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, etc.) i olika skalor (globala, subnät och lokala).

Connectome Viewer: ansluter multimodal och multiskal neuroimaging och nätverksdataset för analys och visualisering i Python.

FSL: Bildanalys och statistiska verktyg för fMRI-, MR- och DTI-hjärnbildningsdata. Länk

Ginkgo CADx: Denna ansökan är en bildvisare sparas under DICOM-standarden.

ITK-Snap: Program för segmentering av strukturer i medicinska 3D-bilder. Länk

Minc verktygslåda: ansökan för hantering av MINC-filer

MITK: verktyg för utveckling av interaktiv programvara för medicinsk bildbehandling.

MITK Diffusion: Programmet  innehåller ett urval av bildanalysalgoritmer för diffusionsvägd magnetisk resonanstomografi.

MRIconvert: Es ett verktyg omvandlare för medicinsk bildfil som konverterar DICOM-filer till volymformaten NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager och MetaImage.

MRIcron: Är ett verktyg visualisering och analys av bilder erhållna genom magnetisk resonans (funktionell).

mrtrix: Är en uppsättning av verktyg för att utföra vit materia-traktografi på diffusionsvägd magnetisk resonanstomografi på ett robust sätt för att korsa fibrer, med begränsad sfärisk avveckling (CSD) och probabilistiska strömlinjer.

Virtuell NMR: Producerar en realistisk simulering av en MR-skanner.


Lämna din kommentar

Din e-postadress kommer inte att publiceras. Obligatoriska fält är markerade med *

*

*

  1. Ansvarig för data: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Syftet med uppgifterna: Kontrollera skräppost, kommentarhantering.
  3. Legitimering: Ditt samtycke
  4. Kommunikation av uppgifterna: Uppgifterna kommer inte att kommuniceras till tredje part förutom enligt laglig skyldighet.
  5. Datalagring: databas värd för Occentus Networks (EU)
  6. Rättigheter: När som helst kan du begränsa, återställa och radera din information.

  1.   Nasher_87 (ARG) sade

    Mycket bra, det finns tillfällen när de ger dig medicinska bilder och du kan bara öppna den med programmet / tittaren som kommer, förresten, bara i Windows. Jag såg DICOMs flera gånger, jag kunde aldrig öppna dem
    «För diffusion MR-bearbetning» Jag är inte läkare, men jag förstår att det är resonansbilder med kontrast (att ta en vätska)

    1.    Diego tyska Gonzalez sade

      Tack för klargörandet.