Analiziranje nevroslikovanja z Linuxom. Lin4Neuro je odličen način za začetek

Številni uporabniki Linuxa so obsedeni z doseči vodstvo na mizi. Zanje ne gre za širjenje proste programske opreme in njenih 4 svoboščin, ampak premagati Microsoft. Zdi se, da jim dejstvo, da je trg osebnih računalnikov dosegel vrh in da sta Google in Apple v mobilnih telefonih v najboljših (najslabših) dneh veliko bolj nevarni kot Microsoftovi, ni videti mar.

Niti ne morejo uživati vodstvo, doseženo v določenih nišah kot so oblak, spletni strežniki oz superračunalniki. Čas raje zapravljajo v sterilnih razpravah z oboževalci Photoshopa ali Excela.

Zato je moja novoletna resolucija predstavite znana brezplačna programska orodja, ki jih lahko uporabljate z velikim uspehom v sektorjih, v katerih večina od nas, ki pišemo na to temo, običajno ne opazimo.

V tej objavi bomo govorili o tem lin4neuroPorazdelitev, ki bi jo morali upoštevati tisti, ki jih zanima slikanje človeških možganov.

Nedvomno je ob upoštevanju, koliko vlade in zasebniki porabijo za zdravje, vreden doseganje kakršnih koli prihrankov pri stroških licenc brez izgube kakovosti oskrbe. To je sektor, kjer ima brezplačna in odprtokodna programska oprema veliko za dati.

Analiziranje nevroslikovanja z Linuxom. Odlično izhodišče za študente in strokovnjake

Gre za izpeljano različico Ubuntuja, ki jo je izdelal profesor na japonski univerzi Tsukuba. Temelji na Ubuntu 16.04 in se zdi, da se ne posodablja od leta 2017. Vendar še vedno predstavlja dobro izhodišče za strokovnjake za nevrosliko spoznajo odprtokodne aplikacije in študentje opravljajo praktična dela.

Analizirane slike lahko delite enostavno

Na seznam programov po možnosti vključim povezave do njihovih strani.

Prosim, upoštevajte, da nisem zdravnik. Čeprav sem se s pomočjo Googla trudil, da so prevodi čim bolj pravilni, sem morda zabrnil. Že cenim kakršen koli popravek.

Med aplikacijami, vključenimi v distribucijo, lahko omenimo:

3D rezalnik: Ta aplikacija Vključuje algoritme za analizo slik, dobljenih s funkcijsko magnetno resonanco in difuzijskim tenzorjem. Uporabljajo se lahko tudi za terapijo s sliko.

AFNI:  Program za obdelavo in analizo podatkov, pridobljenih s slikami z magnetno resonanco.

Orodja za UCL Camino difuzijsko MRI: Opis bom dal v angleščini, da ne bi zamočil. Za obdelavo z difuzijsko magnetno resonanco. Po mojem mnenju gre za analizo difuzne magnetne resonance. Če je v sobi strokovnjak za slikanje, ki nam lahko pojasni težavo, je spodaj obrazec za komentar. Povezava

Karet: Ta aplikacija  uporabniku omogoča ustvarjanje, ogled in upravljanje z rekonstrukcijami površin možganov in možganske skorje.

Connectome analizator: Analiza povezav med viri iz katerega koli vira (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI itd.) V različnih merilih (globalno, podomrežje in lokalno).

Pregledovalnik Connectome: povezuje nabore multimodalnih in multiskalnih nevroloških slik in omrežnih podatkov za analizo in vizualizacijo v Pythonu.

FSL: Analiza slik in statistična orodja za podatke o slikanju možganov fMRI, MRI in DTI. Povezava

Ginko CADx: Ta aplikacija je pregledovalnik slik shranjene pod standardom DICOM.

ITK-Snap: Program za segmentacijo struktur v 3D medicinskih slikah. Povezava

Orodje Minc: Uporaba za obdelavo datotek MINC

MITK: Orodja za razvoj interaktivne programske opreme za medicinsko obdelavo slik.

MITK difuzija: Program  vključuje izbor algoritmov za analizo slike za difuzijsko tehtano slikanje z magnetno resonanco.

MRI Convert: Es pripomoček pretvornik medicinskih slikovnih datotek, ki pretvori datoteke DICOM v NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyse, BrainVoyager in MetaImage.

MRIkron: Je orodje vizualizacija in analiza slik, pridobljenih z magnetno resonanco (funkcionalno).

mrtrix: Je niz orodij za izvajanje traktografije bele snovi na difuzijsko tehtanem magnetnoresonančnem slikanju na močan način za prečkanje vlaken z uporabo omejene sferične dekonvolucije (CSD) in verjetnostnih tokov.

Navidezni NMR: Izdeluje realistično simulacijo MRI skenerja.