Анализ нейровизуализации с помощью Linux. Lin4Neuro - отличный способ начать работу

Анализ нейроизображений с помощью Linux Многие пользователи Linux одержимы добиться лидерства за столом. Для них речь идет не о распространении бесплатного программного обеспечения и его 4 свобод, а о победить Microsoft. Тот факт, что рынок персональных компьютеров достиг пика, и что действия Google и Apple в отношении мобильных телефонов намного опаснее, чем действия Microsoft в их лучшие (худшие) дни, их, похоже, не заботит.

И они не могут наслаждаться лидерство в конкретных нишах таких как облако, веб-серверы или суперкомпьютеры. Они предпочитают тратить время на бесплодные дискуссии с поклонниками Photoshop или Excel.

Вот почему мое новогоднее решение сделать известные бесплатные программные инструменты, которые можно использовать с большим успехом в секторах, в которых большинство из нас, пишущих на эту тему, обычно не замечают.

В этом посте мы поговорим о Лин4нейроРаспределение, которое следует учитывать тем, кто интересуется визуализацией человеческого мозга.

Несомненно, с учетом того, что правительства и частные лица тратят на здравоохранение, любая экономия на стоимости лицензий без потери качества медицинского обслуживания является достойной целью для достижения. Это сектор, в котором бесплатное программное обеспечение с открытым исходным кодом может многое дать.

Анализ нейровизуализации с помощью Linux. Отличная отправная точка для студентов и профессионалов

Это производная версия Ubuntu, созданная профессором японского университета Цукуба. Он основан на Ubuntu 16.04 и, похоже, не обновляется с 2017 года. Однако он по-прежнему составляет хорошая отправная точка для специалистов по нейровизуализации познакомиться с приложениями с открытым исходным кодом и попросить студентов выполнить практическую работу.

Проанализированные изображения можно поделиться легко.

В список программ я по возможности включаю ссылки на соответствующие страницы.

Обратите внимание, что я не врач. Хотя с помощью Google я пытался сделать переводы максимально корректными, возможно, я напортачил. Я уже ценю любые исправления.

Среди приложений, включенных в дистрибутив, можно отметить:

3D-слайсер: Это приложение Он включает алгоритмы анализа изображений, полученных с помощью функциональной магнитно-резонансной томографии и тензора диффузии. Их также можно использовать для терапии под визуальным контролем.

АФНИ:  Программа для обработки и анализа данных, полученных с магнитно-резонансных изображений.

Инструменты UCL Camino Diffusion MRI: Собираюсь выложить описание на английском, чтобы не лажать. Для диффузионной обработки МРТ. Я интерпретирую это как анализ диффузной магнитно-резонансной томографии. Если в комнате есть специалист по визуализации, который может прояснить для нас проблему, ниже находится форма для комментариев. Ссылка

Каретка: Это приложение  позволяет пользователю создавать, просматривать и управлять реконструкциями поверхностей головного мозга и коры головного мозга.

Коннектомный анализатор: Анализ связей между ресурсами из любого источника (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI и др.) В разных масштабах (глобальном, подсетевом и локальном).

Программа просмотра Connectome: связывает мультимодальные и многомасштабные наборы нейровизуализации и сетевых данных для анализа и визуализации в Python.

ФСЛ: Анализ изображений и статистические инструменты для данных изображений мозга с помощью фМРТ, МРТ и DTI. Ссылка

Гинкго CADx: Это приложение просмотрщик изображений сохранены по стандарту DICOM.

ИТК-Snap: Программа для сегментации структур на медицинских 3D-изображениях. Ссылка

Инструментарий Minc: Приложение для обработки файлов MINC

МИТК: инструменты за разработку интерактивного программного обеспечения для обработки медицинских изображений.

МИТК Диффузия: Программа  включает набор алгоритмов анализа изображений для диффузионно-взвешенной магнитно-резонансной томографии.

МРТКонвертировать: Es полезность конвертер файлов медицинских изображений, который конвертирует файлы DICOM в форматы томов NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager и MetaImage.

MRIcron: Это инструмент визуализация и анализ изображений, полученных методом магнитного резонанса (функциональная).

МРтрикс: Это набор инструментов для выполнения трактографии белого вещества на диффузионно-взвешенной магнитно-резонансной томографии надежным способом для пересечения волокон с использованием ограниченной сферической деконволюции (CSD) и вероятностных линий тока.

Виртуальный ЯМР: Создает реалистичную симуляцию сканера МРТ.


Содержание статьи соответствует нашим принципам редакционная этика. Чтобы сообщить об ошибке, нажмите здесь.

2 комментариев, оставьте свой

Оставьте свой комментарий

Ваш электронный адрес не будет опубликован.

*

*

  1. Ответственный за данные: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Назначение данных: контроль спама, управление комментариями.
  3. Легитимация: ваше согласие
  4. Передача данных: данные не будут переданы третьим лицам, кроме как по закону.
  5. Хранение данных: база данных, размещенная в Occentus Networks (ЕС)
  6. Права: в любое время вы можете ограничить, восстановить и удалить свою информацию.

  1.   Нашер_87 (ARG) сказал

    Очень хорошо, бывают случаи, когда вам выдают медицинские изображения, и вы можете открыть их только с помощью программы / средства просмотра, которая, кстати, поставляется только в Windows. Я видел DICOM несколько раз, я никогда не мог их открыть
    «Для диффузионной обработки МРТ» я не врач, но понимаю, что это резонансные снимки с контрастом (снятие жидкости)

    1.    Диего Герман Гонсалес сказал

      Спасибо за разъяснения.