Analyserer nevroavbildning med Linux. Lin4Neuro er en fin måte å komme i gang

Analyse av nevrobilder med Linux

Mange Linux-brukere er besatt av oppnå lederskap ved pulten. For dem handler det ikke om å spre gratis programvare og dens 4 friheter, men for å beseire Microsoft. Det at markedet for personlige datamaskiner har toppet seg, og at Googles og Apples handlinger på mobiltelefoner er mye farligere enn Microsofts på de beste (verste) dagene, synes de ikke bryr seg om.

De er heller ikke i stand til å glede seg ledelse oppnådd i spesifikke nisjer som skyen, webservere eller superdatamaskiner. De kaster bort tid i sterile diskusjoner med fans av Photoshop eller Excel.

Dette er grunnen til at min nyttårsoppløsning er gjøre kjent gratis programvareverktøy som kan brukes med stor suksess i sektorer der de fleste av oss som skriver om emnet vanligvis ikke merker det.

I dette innlegget skal vi snakke om lin4neuroEn distribusjon som bør vurderes av de som er interessert i menneskelig hjerneavbildning.

Utvilsomt, når man tar hensyn til hva regjeringer og private borgere bruker på helse, er enhver besparelse i lisenskostnadene uten tap av kvaliteten på omsorgen et verdig mål å oppnå. Det er en sektor der gratis og åpen kildekode-programvare har mye å gi.

Analyserer nevroavbildning med Linux. Et flott utgangspunkt for studenter og fagpersoner

Det er en avledet versjon av Ubuntu laget av en professor ved det japanske universitetet i Tsukuba. Den er basert på Ubuntu 16.04 og ser ut til å ikke være oppdatert siden 2017. Imidlertid utgjør den fortsatt et godt utgangspunkt for nevroavbildningspersoner bli kjent med applikasjoner med åpen kildekode, og studentene gjør praktisk arbeid.

De analyserte bildene kan deles enkelt.

I listen over programmer inkluderer jeg lenker til deres respektive sider når det er mulig.

Vær oppmerksom på at jeg ikke er lege. Selv om jeg med hjelp fra Google prøvde å gjøre oversettelsene så riktige som mulig, kan det hende jeg har slått til. Jeg setter allerede pris på korreksjon.

Blant applikasjonene som inngår i distribusjonen kan vi nevne:

3D-skjærer: Dette programmet Den inkluderer algoritmer for analyse av bilder oppnådd ved funksjonell magnetisk resonansavbildning og diffusjonstensor. De kan også brukes til bildestyrt terapi.

AFNI:  Program for behandling og analyse av data hentet fra magnetiske resonansbilder.

UCL Way Diffusion MRI Toolki: Jeg kommer til å legge beskrivelsen på engelsk for ikke å skru opp. For diffusjon MR-prosessering. Jeg tolker det for diffus magnetisk resonansbildebehandling. Hvis det er en bildespesialist i rommet som kan avklare problemet for oss, er kommentarsskjemaet nedenfor. Link

Vaktmester: Dette programmet  lar brukeren opprette, se og manipulere rekonstruksjoner av overflater i hjernen og hjernebarken.

Connectome Analyzer: Analyse av forbindelsene mellom ressurser fra hvilken som helst kilde (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, etc.) på forskjellige skalaer (global, delnett og lokal).

Connectome Viewer: kobler sammen multimodale og flerskala nevroavbildning og nettverksdatasett for analyse og visualisering i Python.

FSL: Bildeanalyse og statistiske verktøy for fMRI, MR og DTI hjernedata. Link

Ginkgo CADx: Denne applikasjonen er en bildeviser lagret under DICOM-standarden.

ITK-Snap: Program for segmentering av strukturer i 3D medisinske bilder. Link

Minc verktøysett: Aplicación for håndtering av MINC-filer

MITK: verktøy for utvikling av interaktiv programvare for medisinsk bildebehandling.

MITK spredning: Programmet  inkluderer et utvalg av bildeanalysealgoritmer for diffusjonsvektet magnetisk resonansavbildning.

MRI-konverter: Es et verktøy medisinsk bildefilkonverterer som konverterer DICOM-filer til volumformatene NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager og MetaImage.

MRIcron: Er et verktøy visualisering og analyse av bilder oppnådd ved magnetisk resonans (funksjonell).

mrtrix: Er et sett av verktøy for å utføre hvitt materiale-traktografi på diffusjonsvektet magnetisk resonansavbildning robust for å krysse fibre, ved å bruke begrenset sfærisk dekonvolusjon (CSD) og sannsynlige strømlinjeformer.

Virtuell NMR: Produserer en realistisk simulering av en MR-skanner.


Legg igjen kommentaren

Din e-postadresse vil ikke bli publisert. Obligatoriske felt er merket med *

*

*

  1. Ansvarlig for dataene: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Formålet med dataene: Kontroller SPAM, kommentaradministrasjon.
  3. Legitimering: Ditt samtykke
  4. Kommunikasjon av dataene: Dataene vil ikke bli kommunisert til tredjeparter bortsett fra ved juridisk forpliktelse.
  5. Datalagring: Database vert for Occentus Networks (EU)
  6. Rettigheter: Når som helst kan du begrense, gjenopprette og slette informasjonen din.

  1.   Nasher_87 (ARG) sa

    Veldig bra, det er tider at de gir deg medisinske bilder, og du kan bare åpne det med programmet / visningen som kommer, forresten, bare i Windows. Jeg så DICOM-ene flere ganger, jeg kunne aldri åpne dem
    «For diffusjon MR-behandling» Jeg er ikke lege, men jeg forstår at det er resonansbilder med kontrast (å ta en væske)

    1.    Diego German Gonzalez sa

      Takk for oppklaringen.