Menganalisis neuroimaging dengan Linux. Lin4Neuro adalah kaedah terbaik untuk memulakan

Menganalisis Neuroimages dengan Linux

Banyak pengguna Linux yang taksub mencapai kepimpinan di meja. Bagi mereka ini bukan mengenai menyebarkan perisian percuma dan 4 kebebasannya tetapi untuk mengalahkan Microsoft. Kenyataan bahawa pasaran komputer peribadi telah memuncak, dan tindakan Google dan Apple di telefon bimbit jauh lebih berbahaya daripada Microsoft pada hari-hari terbaik (terburuk) mereka, sepertinya mereka tidak peduli.

Mereka juga tidak dapat menikmati kepimpinan dicapai dalam bidang tertentu seperti awan, pelayan web atau superkomputer. Mereka lebih suka membuang masa dalam perbincangan steril dengan peminat Photoshop atau Excel.

Inilah sebabnya mengapa resolusi Tahun Baru saya membuat alat perisian percuma yang boleh digunakan dengan jayanya dalam sektor di mana kebanyakan kita yang menulis mengenai perkara ini biasanya tidak menyedari.

Dalam catatan ini kita akan bincangkan lin4neuroSebaran yang harus dipertimbangkan oleh mereka yang berminat dalam pencitraan otak manusia.

Tidak diragukan lagi, dengan mempertimbangkan apa yang dibelanjakan oleh pemerintah dan masyarakat swasta untuk kesihatan, segala penjimatan dalam kos lesen tanpa kehilangan kualiti penjagaan adalah tujuan yang layak untuk dicapai. Ini adalah sektor di mana perisian sumber bebas dan terbuka banyak memberi.

Menganalisis neuroimaging dengan Linux. Titik permulaan yang baik untuk pelajar dan profesional

Ini adalah versi terbitan Ubuntu yang dibuat oleh seorang profesor di universiti Jepun di Tsukuba. Ia berdasarkan Ubuntu 16.04 dan nampaknya tidak dikemas kini sejak tahun 2017. Walau bagaimanapun, ia masih tetap berlaku titik permulaan yang baik untuk profesional neuroimaging membiasakan diri dengan aplikasi sumber terbuka dan pelajar membuat kerja amali.

Gambar yang dianalisis boleh dikongsi dengan mudah

Dalam senarai program, saya memasukkan pautan ke halaman masing-masing apabila boleh.

Harap maklum bahawa saya bukan doktor. Walaupun dengan pertolongan Google, saya berusaha menjadikan terjemahannya setepat mungkin, saya mungkin telah mengacaukannya. Saya sudah menghargai sebarang pembetulan.

Di antara aplikasi yang disertakan dalam pengedaran kita boleh menyebutkan:

Pemotong 3D: Permohonan ini Ia merangkumi algoritma untuk analisis gambar yang diperoleh dengan pengimejan resonans magnetik fungsional dan dengan tensor resapan. Mereka juga boleh digunakan untuk terapi berpandukan gambar.

AFNI:  program untuk pemprosesan dan analisis data yang diperoleh dari gambar resonans magnetik.

UCL Way Diffusion MRI Toolki: Saya akan meletakkan keterangan dalam bahasa Inggeris agar tidak merosakkan. Untuk pemprosesan MRI resapan. Saya mentafsirkannya untuk analisis pencitraan resonans magnetik yang meresap. Sekiranya terdapat pakar pengimejan di ruangan yang dapat menjelaskan masalahnya kepada kami, ada borang komen di bawah. enlace

Karet: Permohonan ini  membolehkan pengguna membuat, melihat dan memanipulasi pembinaan semula permukaan otak dan korteks serebrum.

Penganalisis Connectome: Analisis hubungan antara sumber dari mana-mana sumber (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, dll.) Pada skala yang berbeza (global, subnet dan tempatan).

Penonton Connectome: menghubungkan set data neuroimaging dan rangkaian multimodal dan multiscale untuk analisis dan visualisasi di Python.

FSL: Analisis gambar dan alat statistik untuk data pengimejan otak fMRI, MRI, dan DTI. enlace

Ginkgo CADx: Aplikasi ini adalah penonton gambar disimpan di bawah standard DICOM.

ITK-Snap: Program untuk segmentasi struktur dalam gambar perubatan 3D. enlace

Kit alat minc: Permohonan untuk mengendalikan fail MINC

MITK: Tools untuk pembangunan perisian interaktif untuk pemprosesan imej perubatan.

Penyebaran MITK: Program ini  merangkumi pemilihan algoritma analisis gambar untuk pengimejan resonans magnetik berwajaran difusi.

Tukar MRIC: Es sebuah utiliti penukar fail imej perubatan yang menukar fail DICOM ke NIfTI 1.1, Analisis 7.5, SPM99 / Analisis, format kelantangan BrainVoyager dan MetaImage.

MRIcron: Adakah alat visualisasi dan analisis gambar yang diperoleh dengan resonans magnetik (berfungsi).

mrtrix: Adakah satu set alat untuk melakukan traktografi jirim putih pada pengimejan resonans magnetik berwajaran difusi dengan kuat ke serat silang, menggunakan dekonvolusi sfera terhad (CSD) dan aliran arus probabilistik

NMR maya: Menghasilkan simulasi realistik pengimbas MRI.


Tinggalkan komen anda

Alamat email anda tidak akan disiarkan. Ruangan yang diperlukan ditanda dengan *

*

*

  1. Bertanggungjawab untuk data: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Tujuan data: Mengendalikan SPAM, pengurusan komen.
  3. Perundangan: Persetujuan anda
  4. Komunikasi data: Data tidak akan disampaikan kepada pihak ketiga kecuali dengan kewajiban hukum.
  5. Penyimpanan data: Pangkalan data yang dihoskan oleh Occentus Networks (EU)
  6. Hak: Pada bila-bila masa anda boleh menghadkan, memulihkan dan menghapus maklumat anda.

  1.   Nasher_87 (ARG) kata

    Sangat bagus, ada kalanya mereka memberikan gambar perubatan dan anda hanya dapat membukanya dengan program / penonton yang datang, secara kebetulan, hanya di Windows. Saya melihat DICOM beberapa kali, saya tidak dapat membukanya
    «Untuk pemprosesan MRI penyebaran» Saya bukan doktor, tetapi saya faham bahawa ia adalah gambar resonans dengan kontras (mengambil cecair)

    1.    Diego Jerman Gonzalez kata

      Terima kasih atas penjelasan.