Neiro attēlveidošanas analīze, izmantojot Linux. Lin4Neuro ir lielisks veids, kā sākt darbu

Neiroattēlu analizēšana ar Linux

Daudzi Linux lietotāji ir apsēsti panākt vadību pie galda. Viņiem tas nav par brīvās programmatūras un tās 4 brīvību izplatīšanu, bet gan uzvarēt Microsoft. Fakts, ka personālo datoru tirgus ir sasniedzis maksimumu un ka Google un Apple darbības ar mobilajiem tālruņiem ir daudz bīstamākas nekā Microsoft savās labākajās (sliktākajās) dienās, šķiet, ka viņiem ir vienalga.

Viņi arī nespēj izbaudīt vadība, kas sasniegta konkrētās nišās piemēram, mākonis, tīmekļa serveri vai superdatori. Viņi izvēlas tērēt laiku sterilās diskusijās ar Photoshop vai Excel faniem.

Tāpēc mana Jaungada rezolūcija ir padarīt zināmus bezmaksas programmatūras rīkus, kurus var izmantot ar lieliem panākumiem nozarēs, kurās lielākā daļa no mums, kas raksta par šo tēmu, parasti nepamana.

Šajā amatā mēs runāsim lin4neuroSadalījums, kas jāņem vērā tiem, kurus interesē cilvēka smadzeņu attēlveidošana.

Neapšaubāmi, ņemot vērā to, ko valdības un privātie iedzīvotāji tērē veselībai, jebkurš licenču izmaksu ietaupījums, nezaudējot aprūpes kvalitāti, ir cienīgs mērķis, kas jāsasniedz. Tā ir nozare, kurā bezmaksas un atvērtā pirmkoda programmatūrai ir daudz ko dot.

Neiro attēlveidošanas analīze, izmantojot Linux. Lielisks sākumpunkts studentiem un profesionāļiem

Tā ir atvasināta Ubuntu versija, ko izgatavojis Japānas Tsukubas universitātes profesors. Tas ir balstīts uz Ubuntu 16.04 un, šķiet, nav atjaunināts kopš 2017. gada. Tomēr tas joprojām ir labs sākumpunkts neiro attēlveidošanas profesionāļiem iepazīties ar atvērtā pirmkoda lietojumprogrammām un likt studentiem veikt praktiskus darbus.

Analizētie attēli var koplietot viegli.

Programmu sarakstā es pēc iespējas ievietoju saites uz to attiecīgajām lapām.

Lūdzu, ņemiet vērā, ka es neesmu ārsts. Lai gan ar Google palīdzību es centos padarīt tulkojumus pēc iespējas pareizākus, iespējams, ka esmu skrūvējis. Es jau novērtēju jebkuru labojumu.

Starp izplatīšanā iekļautajām lietojumprogrammām mēs varam pieminēt:

3D griezējs: Šī lietotne Tas ietver algoritmus attēlu analīzei, kas iegūti, izmantojot funkcionālo magnētiskās rezonanses attēlveidošanu un difūzijas tenoru. Tos var izmantot arī terapijai ar attēlu.

AFNI:  programma magnētiskās rezonanses attēlu iegūto datu apstrādei un analīzei.

UCL Camino difūzijas MRI rīki: Es ievietošu aprakstu angļu valodā, lai nesaskrūvētu. Difūzijas MRI apstrādei. Es to interpretēju kā difūzās magnētiskās rezonanses attēlveidošanas analīzi. Ja telpā ir attēlveidošanas speciālists, kurš var mums precizēt problēmu, zemāk ir komentāru veidlapa. apvīt

Sargs: Šī lietotne  ļauj lietotājam izveidot, apskatīt un manipulēt ar smadzeņu un smadzeņu garozas virsmu rekonstrukcijām.

Connectome analizators: Analīze par savienojumiem starp resursiem no jebkura avota (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI utt.) Dažādos mērogos (globālā, apakštīklu un lokālā).

Connectome skatītājs: savieno multimodālo un daudzciparu neiroattēlveidošanu un tīkla datu kopas analīzei un vizualizēšanai Python.

FSL: Attēlu analīze un statistikas rīki fMRI, MRI un DTI smadzeņu attēlveidošanas datiem. apvīt

Ginkgo CADx: Šis pieteikums ir a attēlu skatītājs saglabāti saskaņā ar DICOM standartu.

ITK-Snap: 3D medicīnisko attēlu struktūru segmentēšanas programma. apvīt

Minc rīkkopa: Iesniegums par MINC failu apstrādi

MITK: darbarīki interaktīvas programmatūras izstrādei medicīnisko attēlu apstrādei.

MITK difūzija: Programma  ietver attēlu analīzes algoritmu izvēli magnētiskās rezonanses attēlveidošanai ar difūziju.

MRIConvert: Es lietderība medicīnisko attēlu failu pārveidotājs, kas DICOM failus pārveido par NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager un MetaImage apjoma formātiem.

MRIcron: Ir rīks ar magnētisko rezonansi iegūto attēlu vizualizācija un analīze (funkcionāla).

mrtrix: Ir komplekts instrumentu baltās vielas traktogrāfijas veikšanai ar difūzijas svērto magnētiskās rezonanses attēlveidošanu, stingri šķērsojot šķiedras, izmantojot ierobežotas sfēriskās dekonvolūcijas (CSD) un varbūtības plūsmas.

Virtuālā KMR: Izgatavo reālistisku MRI skenera simulāciju.


Atstājiet savu komentāru

Jūsu e-pasta adrese netiks publicēta. Obligātie lauki ir atzīmēti ar *

*

*

  1. Atbildīgais par datiem: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Datu mērķis: SPAM kontrole, komentāru pārvaldība.
  3. Legitimācija: jūsu piekrišana
  4. Datu paziņošana: Dati netiks paziņoti trešām personām, izņemot juridiskus pienākumus.
  5. Datu glabāšana: datu bāze, ko mitina Occentus Networks (ES)
  6. Tiesības: jebkurā laikā varat ierobežot, atjaunot un dzēst savu informāciju.

  1.   Nasher_87 (ARG) teica

    Ļoti labi, ir gadījumi, kad viņi sniedz jums medicīniskus attēlus, un jūs varat tos atvērt tikai ar programmu / skatītāju, kas, starp citu, nāk tikai sistēmā Windows. Es vairākas reizes redzēju DICOM, es nekad tos nevarēju atvērt
    «Difūzijas MRI apstrādei» neesmu ārsts, bet saprotu, ka tie ir rezonanses attēli ar kontrastu (šķidruma uzņemšana)

    1.    Djego Vācis Gonzaless teica

      Paldies par precizējumu.