Neurografinio vaizdo analizavimas naudojant „Linux“. „Lin4Neuro“ yra puikus būdas pradėti

Daugelis „Linux“ vartotojų yra apsėsti pasiekti lyderystės prie stalo. Jiems tai nėra laisvos programinės įrangos ir 4 jos laisvių skleidimas, bet nugalėti „Microsoft“. Tai, kad asmeninių kompiuterių rinka pasiekė aukščiausią tašką ir kad „Google“ ir „Apple“ veiksmai mobiliaisiais telefonais yra daug pavojingesni nei „Microsoft“ geriausiomis (blogiausiomis) dienomis, atrodo, kad jiems tai nerūpi.

Jie taip pat negali džiaugtis lyderystė pasiekta konkrečiose nišose pvz., debesys, interneto serveriai ar superkompiuteriai. Jie nori gaišti laiką steriliose diskusijose su „Photoshop“ ar „Excel“ gerbėjais.

Štai kodėl mano Naujųjų metų rezoliucija yra tokia padaryti žinomus nemokamos programinės įrangos įrankius, kuriuos galima labai sėkmingai naudoti sektoriuose, kuriuose dauguma iš mūsų, rašantys šia tema, paprastai to nepastebi.

Šiame įraše mes kalbėsime lin4neuroPaskirstymas, į kurį turėtų atsižvelgti tie, kurie domisi žmogaus smegenų vaizdavimu.

Be abejo, atsižvelgiant į tai, ką vyriausybės ir privatūs piliečiai išleidžia sveikatai, bet koks licencijų kainos sutaupymas, neprarandant sveikatos priežiūros kokybės, yra tikslas, kurį verta pasiekti. Tai sektorius, kuriame nemokama ir atviro kodo programinė įranga turi daug ką duoti.

Neurografavimo analizavimas naudojant „Linux“. Puikus atspirties taškas studentams ir specialistams

Tai išvestinė „Ubuntu“ versija, kurią sukūrė Japonijos Tsukubos universiteto profesorius. Jis pagrįstas „Ubuntu 16.04“ ir, atrodo, nėra atnaujinamas nuo 2017 m. Tačiau jis vis dar yra geras atspirties taškas neurovizijos specialistams susipažinti su atvirojo kodo programomis ir priversti studentus atlikti praktinius darbus.

Išanalizuoti vaizdai galima dalintis lengvai

Į programų sąrašą įtraukiu nuorodas į atitinkamus jų puslapius, kai tik įmanoma.

Atkreipkite dėmesį, kad nesu gydytojas. Nors su „Google“ pagalba bandžiau padaryti vertimus kuo teisingesnius, galbūt įsukau. Aš jau vertinu bet kokią korekciją.

Tarp platinimo programų galime paminėti:

3D pjaustyklė: Ši programa Jame yra vaizdų, gautų atliekant funkcinį magnetinio rezonanso vaizdą ir difuzinį tensorių, analizės algoritmai. Jie taip pat gali būti naudojami terapijai su vaizdu.

AFNI:  Programa duomenų, gautų iš magnetinio rezonanso vaizdų, apdorojimui ir analizei.

UCL Camino difuzijos MRT įrankis: Aš parašysiu aprašymą anglų kalba, kad nesukčiau. Difuziniam MRT apdorojimui. Aš tai interpretuoju kaip difuzinio magnetinio rezonanso vaizdavimo analizę. Jei kambaryje yra vaizdo gavimo specialistas, kuris gali mums išsiaiškinti problemą, žemiau pateikiama komentaro forma. apraizgyti

Sargas: Ši programa  leidžia vartotojui kurti, peržiūrėti ir manipuliuoti smegenų ir smegenų žievės paviršių rekonstrukcijomis.

„Connectome“ analizatorius: Ryšių tarp bet kokio šaltinio (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI ir kt.) Ryšių analizė skirtingais mastais (pasaulinė, potinklių ir vietinė).

„Connectome Viewer“: sujungia daugiamodalius ir daugialypius neurovizavimo ir tinklo duomenų rinkinius analizei ir vizualizacijai „Python“.

FSL: Vaizdų analizė ir statistinės priemonės fMRI, MRT ir DTI smegenų vaizdavimo duomenims. apraizgyti

Ginkmedis CADx: Ši programa yra a nuotraukų žiūrovas išsaugotas pagal DICOM standartą.

„ITK-Snap“: 3D medicininių vaizdų struktūrų segmentavimo programa. apraizgyti

„Minc“ įrankių rinkinys: Taikymas tvarkyti MINC failus

MITK: Įrankiai interaktyvios medicininių vaizdų apdorojimo programinės įrangos kūrimui.

MITK difuzija: Programa  apima vaizdų analizės algoritmų pasirinkimą difuzijai įvertintam magnetinio rezonanso vaizdavimui.

MRIC konvertuoti: Es naudingumas medicininių vaizdų failų keitiklis, kuris konvertuoja DICOM failus į NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager ir MetaImage tūrio formatus.

MRIcron: Yra įrankis magnetinio rezonanso būdu gautų vaizdų vizualizavimas ir analizė (funkcinis).

mrtrix: Yra rinkinys įrankių, skirtų atlikti baltosios medžiagos traktografiją difuzijos būdu įvertintame magnetinio rezonanso vizualizavime, kad būtų galima kirsti pluoštus, naudojant ribotą sferinę dekonvoliuciją (CSD) ir tikimybinius srautus.

Virtuali BMR: Sukuria tikrovišką MRT skaitytuvo modeliavimą.