Menganalisis neuroimaging dengan Linux. Lin4Neuro adalah cara terbaik untuk memulai

Menganalisis neuroimaging dengan Linux

Banyak pengguna Linux terobsesi dengan mencapai kepemimpinan di meja. Bagi mereka ini bukan tentang menyebarkan perangkat lunak bebas dan 4 kebebasannya, tetapi untuk mengalahkan Microsoft. Fakta bahwa pasar untuk komputer pribadi telah mencapai puncaknya, dan bahwa tindakan Google dan Apple pada ponsel jauh lebih berbahaya daripada Microsoft di hari-hari terbaik (terburuk) mereka, mereka tampaknya tidak peduli.

Mereka juga tidak bisa menikmati kepemimpinan yang dicapai di ceruk tertentu seperti cloud, server web, atau superkomputer. Mereka lebih suka membuang waktu dalam diskusi steril dengan penggemar Photoshop atau Excel.

Inilah mengapa resolusi Tahun Baru saya adalah beri tahu perangkat lunak gratis yang dapat digunakan dengan sukses besar di sektor-sektor di mana kebanyakan dari kita yang menulis tentang masalah ini biasanya tidak menyadarinya.

Dalam posting ini kita akan berbicara tentang lin4neuroDistribusi yang harus dipertimbangkan oleh mereka yang tertarik dengan pencitraan otak manusia.

Tidak diragukan lagi, dengan mempertimbangkan apa yang dibelanjakan pemerintah dan warga negara untuk kesehatan, penghematan biaya perizinan tanpa kehilangan kualitas perawatan adalah tujuan yang layak dicapai. Ini adalah sektor di mana perangkat lunak bebas dan sumber terbuka memiliki banyak hal untuk diberikan.

Menganalisis neuroimaging dengan Linux. Titik awal yang bagus untuk pelajar dan profesional

Ini adalah versi turunan dari Ubuntu yang dibuat oleh seorang profesor di universitas Tsukuba di Jepang. Ini didasarkan pada Ubuntu 16.04 dan tampaknya tidak diperbarui sejak 2017. Namun, ini masih merupakan titik awal yang baik untuk para profesional neuroimaging menjadi terbiasa dengan aplikasi open source dan siswa melakukan kerja praktek.

Gambar yang dianalisis bisa dibagikan dengan mudah.

Dalam daftar program saya menyertakan tautan ke halaman masing-masing bila memungkinkan.

Harap dicatat bahwa saya bukan seorang dokter. Meskipun dengan bantuan Google saya mencoba membuat terjemahannya benar, saya mungkin salah. Saya menghargai koreksi apapun.

Di antara aplikasi yang termasuk dalam distribusi, kami dapat menyebutkan:

Pemotong 3D: Aplikasi ini Ini mencakup algoritma untuk analisis gambar yang diperoleh dengan pencitraan resonansi magnetik fungsional dan dengan tensor difusi. Mereka juga dapat digunakan untuk terapi dengan panduan gambar.

AFNI:  program untuk pengolahan dan analisis data yang diperoleh dari citra resonansi magnetik.

UCL Camino Difusi MRI Toolki: Saya akan memberikan deskripsi dalam bahasa Inggris agar tidak mengacaukan. Untuk pemrosesan MRI difusi. Saya menafsirkannya untuk analisis pencitraan resonansi magnetik difus. Jika ada spesialis pencitraan di ruangan yang dapat mengklarifikasi masalah ini untuk kami, ada formulir komentar di bawah. Melingkungi

Tanda sisipan: Aplikasi ini  memungkinkan pengguna untuk membuat, melihat dan memanipulasi rekonstruksi permukaan otak dan korteks serebral.

Penganalisis Connectome: Analisis koneksi antara sumber daya dari sumber apa pun (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, dll.) Pada skala yang berbeda (global, subnet, dan lokal).

Penampil Connectome: menghubungkan neuroimaging multimodal dan multiskala serta kumpulan data jaringan untuk analisis dan visualisasi dengan Python.

FSL: Analisis gambar dan alat statistik untuk data pencitraan otak fMRI, MRI, dan DTI. Melingkungi

Ginkgo CADx: Aplikasi ini adalah penampil gambar disimpan di bawah standar DICOM.

ITK-Jepret: Program untuk segmentasi struktur dalam gambar medis 3D. Melingkungi

Toolkit Minc: Aplikasi untuk menangani file MINC

MITK: alat untuk pengembangan perangkat lunak interaktif untuk pemrosesan citra medis.

Difusi MITK: Programnya  mencakup pilihan algoritma analisis gambar untuk pencitraan resonansi magnetik berbobot difusi.

Konversi MRI: Es sebuah utilitas konverter file gambar medis yang mengubah file DICOM ke format volume NIfTI 1.1, Analisis 7.5, SPM99 / Analisis, BrainVoyager dan MetaImage.

MRIcron: Adalah sebuah alat visualisasi dan analisis citra diperoleh dengan resonansi magnetik (fungsional).

mrtrix: Adalah satu set alat untuk melakukan traktografi materi putih pada pencitraan resonansi magnetik berbobot difusi dengan cara yang kuat untuk melintasi serat, menggunakan dekonvolusi bola terbatas (CSD) dan garis arus probabilistik.

NMR virtual: Menghasilkan simulasi realistis dari pemindai MRI.


tinggalkan Komentar Anda

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Bidang yang harus diisi ditandai dengan *

*

*

  1. Bertanggung jawab atas data: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Tujuan data: Mengontrol SPAM, manajemen komentar.
  3. Legitimasi: Persetujuan Anda
  4. Komunikasi data: Data tidak akan dikomunikasikan kepada pihak ketiga kecuali dengan kewajiban hukum.
  5. Penyimpanan data: Basis data dihosting oleh Occentus Networks (UE)
  6. Hak: Anda dapat membatasi, memulihkan, dan menghapus informasi Anda kapan saja.

  1.   Nasher_87 (ARG) dijo

    Bagus sekali, ada kalanya mereka memberi Anda gambar medis dan Anda hanya bisa membukanya dengan program / viewer yang datang, kebetulan, hanya di Windows. Saya melihat DICOM beberapa kali, saya tidak pernah bisa membukanya
    «Untuk pemrosesan MRI difusi» Saya bukan seorang dokter, tetapi saya memahami bahwa ini adalah gambar resonansi dengan kontras (mengambil cairan)

    1.    Diego German Gonzalez dijo

      Terimakasih atas klarifikasinya.