Idegképalkotás elemzése Linuxon. A Lin4Neuro nagyszerű módja a kezdésnek

A Neuroimages elemzése Linux alatt

Sok Linux-felhasználó megszállottja vezetést érjen el az íróasztalnál. Számukra nem a szabad szoftverek és 4 szabadságainak terjesztéséről van szó, hanem hogy legyőzze a Microsoftot. Az a tény, hogy a személyi számítógépek piaca elérte a csúcsot, és hogy a Google és az Apple mobiltelefonokkal kapcsolatos intézkedései sokkal veszélyesebbek, mint a Microsofté a legjobb (legrosszabb) napjaiban, úgy tűnik, nem érdekli őket.

Élvezni sem képesek meghatározott résekben elért vezetés mint például a felhő, webszerverek vagy szuperszámítógépek. Inkább időt vesztegetnek a Photoshop vagy az Excel rajongóival folytatott steril beszélgetések során.

Ezért vagyok az újévi állásfoglalásom ismertessenek ingyenes szoftvereszközöket, amelyek nagy sikerrel használhatók azokban az ágazatokban, ahol a legtöbb, a témáról író ember általában nem veszi észre.

Ebben a bejegyzésben fogunk beszélni lin4neuroOlyan eloszlás, amelyet az emberi agy képalkotása iránt érdeklődőknek figyelembe kell venniük.

Kétségtelen, hogy figyelembe véve, hogy a kormányok és a magánpolgárok mit költenek az egészségügyre, az engedélyek költségeinek bármilyen megtakarítása az ellátás minőségének romlása nélkül méltó cél. Ez egy olyan szektor, ahol az ingyenes és nyílt forráskódú szoftvereknek sokat kell adni.

Idegképalkotás elemzése Linuxon. Nagyszerű kiindulópont a hallgatók és a szakemberek számára

Az Ubuntu egy származtatott változata, amelyet a tsukubai japán egyetem professzora készített. Az Ubuntu 16.04-re épül, és úgy tűnik, hogy nem frissítették 2017 óta. Azonban még mindig az jó kiindulópont az idegépalkotó szakemberek számára ismerkedjen meg a nyílt forráskódú alkalmazásokkal, és gyakorolja a hallgatók gyakorlati munkáját.

Az elemzett képek meg lehet osztani könnyen.

A programok listájába lehetőség szerint belefoglalom a megfelelő oldalakra mutató linkeket.

Felhívjuk figyelmét, hogy nem vagyok orvos. Bár a Google segítségével próbáltam a lehető leghelyesebbé tenni a fordításokat, lehet, hogy elcsesztem. Már értékelem a korrekciókat.

A disztribúcióban szereplő alkalmazások közül megemlíthetjük:

3D szeletelő: Ez a kb Funkcionális mágneses rezonancia képalkotással és diffúziós tenzorral kapott képek elemzésére szolgáló algoritmusokat tartalmaz. Képvezérelt terápiára is használhatók.

AFNI:  Program mágneses rezonancia képekből nyert adatok feldolgozásához és elemzéséhez.

UCL Camino Diffusion MRI Eszközök: Angolul fogom feltenni a leírást, nehogy elcseszem. Diffúziós MRI feldolgozáshoz. Úgy értelmezem, hogy diffúz mágneses rezonancia képalkotó elemzésre szolgál. Ha van olyan képalkotó szakember a teremben, aki tisztázhatja számunkra a kérdést, akkor az alábbi megjegyzési űrlap található. Link

Hiányjel: Ez a kb  lehetővé teszi a felhasználó számára az agy és az agykéreg felszínének rekonstrukcióinak létrehozását, megtekintését és manipulálását.

Connectome elemző: Bármely forrásból származó források (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI stb.) Közötti kapcsolatok elemzése különböző léptékekben (globális, alhálózatok és helyi).

Connectome Viewer: összekapcsolja a multimodális és multiszkálájú neurofelvételeket és a hálózati adathalmazokat elemzés és megjelenítés céljából a Pythonban.

FSL: Képelemzés és statisztikai eszközök az fMRI, MRI és DTI agyi képalkotó adatokhoz. Link

Ginkgo CADx: Ez az alkalmazás a képek megtekintője mentve a DICOM szabvány szerint.

ITK-Snap: Program a 3D orvosi képek struktúráinak szegmentálására. Link

Minc eszköztár: kérelem a MINC fájlok kezeléséhez

MITK: Eszközök interaktív szoftverek fejlesztésére orvosi képfeldolgozáshoz.

MITK diffúzió: A program  képelemzési algoritmusokat tartalmaz a diffúzióval súlyozott mágneses rezonancia képalkotáshoz.

MRIConvert: Es egy segédprogram orvosi képfájl-átalakító, amely a DICOM fájlokat NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99 / Analyze, BrainVoyager és MetaImage kötetformátumokká konvertálja.

MRIcron: Van egy eszköz mágneses rezonanciával (funkcionális) kapott képek vizualizálása és elemzése.

mrtrix: Van egy sor eszközök fehér anyagtraktográfia elvégzésére diffúzióval súlyozott mágneses rezonancia képalkotáson robusztus módon a szálak keresztezéséhez, korlátozott gömbös dekonvolúció (CSD) és valószínűségi áramvonalak alkalmazásával.

Virtuális NMR: Reális szimulációt készít egy MRI szkennerről.


Hagyja megjegyzését

E-mail címed nem kerül nyilvánosságra. Kötelező mezők vannak jelölve *

*

*

  1. Az adatokért felelős: AB Internet Networks 2008 SL
  2. Az adatok célja: A SPAM ellenőrzése, a megjegyzések kezelése.
  3. Legitimáció: Az Ön beleegyezése
  4. Az adatok közlése: Az adatokat csak jogi kötelezettség alapján továbbítjuk harmadik felekkel.
  5. Adattárolás: Az Occentus Networks (EU) által üzemeltetett adatbázis
  6. Jogok: Bármikor korlátozhatja, helyreállíthatja és törölheti adatait.

  1.   Nasher_87 (ARG) dijo

    Nagyon jó, vannak olyan esetek, amikor orvosi képeket adnak Önnek, és csak azzal a programmal / megtekintővel nyithatja meg, amely egyébként csak a Windows rendszerben érkezik. Többször láttam a DICOM-okat, soha nem tudtam kinyitni őket
    «Diffúziós MRI feldolgozáshoz» nem vagyok orvos, de megértem, hogy rezonancia képek kontrasztosak (folyadékot vesznek fel)

    1.    Diego német Gonzalez dijo

      Köszönet a tisztázásért.