Πολλοί linuxers έχουν εμμονή επιτύχει ηγεσία στο γραφείο. Για αυτούς δεν πρόκειται για τη διάδοση του ελεύθερου λογισμικού και των 4 ελευθεριών του αλλά να νικήσει τη Microsoft. Το γεγονός ότι η αγορά των προσωπικών υπολογιστών έχει κορυφωθεί και οι ενέργειες της Google και της Apple στην αγορά κινητής τηλεφωνίας είναι πολύ πιο επικίνδυνες από αυτές της Microsoft στις καλύτερες (χειρότερες) στιγμές της, δεν φαίνεται να τους ενδιαφέρει.
Δεν είναι σε θέση να απολαύσουν ηγεσία που επιτυγχάνεται σε συγκεκριμένες θέσεις όπως το σύννεφο, οι διακομιστές ιστού ή υπερυπολογιστές. Προτιμούν να χάνουν χρόνο σε στείρες συζητήσεις με φανατικούς του Photoshop ή του Excel.
Γι' αυτό το ψήφισμά μου για την Πρωτοχρονιά είναι κάνουν γνωστά εργαλεία ελεύθερου λογισμικού που μπορούν να χρησιμοποιηθούν με μεγάλη επιτυχία σε τομείς που οι περισσότεροι από εμάς που γράφουμε για το θέμα συνήθως δεν δίνουμε σημασία.
Σε αυτήν την ανάρτηση πρόκειται να μιλήσουμε lin4neuro.Μια κατανομή που θα πρέπει να λάβουν υπόψη όσοι ενδιαφέρονται για την απεικόνιση του ανθρώπινου εγκεφάλου.
Αναμφίβολα, λαμβανομένου υπόψη του τι ξοδεύουν οι κυβερνήσεις και οι ιδιώτες πολίτες για την υγεία, οποιαδήποτε εξοικονόμηση στο κόστος των αδειών χωρίς απώλεια στην ποιότητα της περίθαλψης είναι ένας στόχος που αξίζει να επιτευχθεί. Αυτός είναι ένας τομέας όπου το δωρεάν λογισμικό ανοιχτού κώδικα έχει πολλά να προσφέρει.
Ανάλυση νευροαπεικόνισης με Linux. Ένα εξαιρετικό σημείο εκκίνησης για φοιτητές και επαγγελματίες
Είναι μια παράγωγη έκδοση του Ubuntu που φτιάχτηκε από έναν καθηγητή στο Ιαπωνικό Πανεπιστήμιο της Tsukuba. Βασίζεται στο Ubuntu 16.04 και φαίνεται να μην έχει ενημερωθεί από το 2017. Ωστόσο, εξακολουθεί να ένα καλό σημείο εκκίνησης για τους επαγγελματίες στην ανάλυση νευροαπεικόνισης εξοικειωθούν με εφαρμογές ανοιχτού κώδικα και οι μαθητές κάνουν πρακτικές ασκήσεις.
Οι εικόνες που αναλύθηκαν μπορεί να μοιραστεί εύκολα.
Στη λίστα των προγραμμάτων συμπεριλαμβάνω τους συνδέσμους προς τις αντίστοιχες σελίδες τους όποτε είναι δυνατόν.
Σημειώστε ότι δεν είμαι γιατρός. Αν και με τη βοήθεια της Google προσπάθησα να κάνω τις μεταφράσεις όσο πιο σωστές γινόταν, μπορεί να τα χάλασα. Ευχαριστώ εκ των προτέρων για οποιαδήποτε διόρθωση.
Μεταξύ των εφαρμογών που περιλαμβάνονται στη διανομή μπορούμε να αναφέρουμε:
3D Slicer: Αυτή η εφαρμογή Περιλαμβάνει αλγόριθμους για την ανάλυση εικόνων που λαμβάνονται με λειτουργικό μαγνητικό συντονισμό και με τανυστή διάχυσης. Μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για θεραπείες με καθοδήγηση εικόνας.
ΑΦΝΗ: Πρόγραμμα για την επεξεργασία και ανάλυση δεδομένων που λαμβάνονται από εικόνες μαγνητικού συντονισμού.
Εργαλείο μαγνητικής τομογραφίας UCL Diffusion Pathway: Πάω να βάλω την περιγραφή στα αγγλικά για να μην μπερδέψω. Για επεξεργασία μαγνητικής τομογραφίας διάχυσης. Ερμηνεύω ότι είναι για την ανάλυση εικόνων διάχυτου μαγνητικού συντονισμού. Εάν υπάρχει ένας ειδικός απεικόνισης στο δωμάτιο που μπορεί να μας διευκρινίσει το θέμα, υπάρχει η παρακάτω φόρμα σχολίων. Σύνδεσμος
αγκύλη: Αυτή η εφαρμογή επιτρέπει στον χρήστη να δημιουργεί, να βλέπει και να χειρίζεται επιφανειακές ανακατασκευές του εγκεφάλου και του εγκεφαλικού φλοιού.
Αναλυτής Connectome: Ανάλυση συνδέσεων μεταξύ πόρων από οποιαδήποτε πηγή (DSI, DTI, QBall, rs-fMRI, κ.λπ.) σε διαφορετικές κλίμακες (παγκόσμια, υποδίκτυα και τοπική).
Connectome Viewer: συνδέει σύνολα δεδομένων νευροαπεικόνισης πολλαπλής κλίμακας και πολλαπλών τρόπων για ανάλυση και οπτικοποίηση σε Python.
FSL: Ανάλυση εικόνας και στατιστικά εργαλεία για δεδομένα απεικόνισης εγκεφάλου fMRI, MRI και DTI. Σύνδεσμος
Ginkgo CADx: Αυτή η εφαρμογή είναι α προβολής εικόνων αποθηκευμένο σύμφωνα με το πρότυπο DICOM.
ITK-Snap: Πρόγραμμα για την κατάτμηση δομών σε τρισδιάστατες ιατρικές εικόνες. Σύνδεσμος
κιτ εργαλείων minc: εφαρμογή για το χειρισμό αρχείων MINC
MITK: εργαλεία για την ανάπτυξη διαδραστικού λογισμικού επεξεργασίας ιατρικών εικόνων.
Διάχυση MITK: Το πρόγραμμα περιλαμβάνει μια επιλογή αλγορίθμων ανάλυσης εικόνας για επεξεργασία απεικόνισης μαγνητικού συντονισμού με στάθμιση διάχυσης.
MRIConvert: Es ένα βοηθητικό πρόγραμμα Λογισμικό μετατροπής ιατρικών αρχείων εικόνας που μετατρέπει αρχεία DICOM σε μορφές τόμου NIfTI 1.1, Analyze 7.5, SPM99/Analyze, BrainVoyager και MetaImage.
MRIcron: Είναι ένα εργαλείο οπτικοποίηση και ανάλυση εικόνων που λαμβάνονται με μαγνητικό συντονισμό (λειτουργική).
MRtrix: Είναι ένα σύνολο εργαλείων για την εκτέλεση τρακτογραφίας λευκής ουσίας σε απεικόνιση μαγνητικού συντονισμού με στάθμιση διάχυσης με στιβαρό τρόπο διασταυρούμενης ίνας, με χρήση περιορισμένης σφαιρικής αποσυνέλιξης (CSD) και πιθανοτικών γραμμών.
εικονική μαγνητική τομογραφία: Παράγει μια ρεαλιστική προσομοίωση ενός σαρωτή μαγνητικής τομογραφίας.
Πολύ καλό, υπάρχουν φορές που σου δίνουν ιατρικές εικόνες και μπορείς να τις ανοίξεις μόνο με το πρόγραμμα/προβολή που το συνοδεύει, παρεμπιπτόντως, μόνο στα Windows. Είδα πολλές φορές το DICOM, δεν μπόρεσα ποτέ να το ανοίξω
"Για επεξεργασία μαγνητικής τομογραφίας διάχυσης" Δεν είμαι γιατρός, αλλά καταλαβαίνω ότι είναι εικόνες συντονισμού με αντίθεση (λήψη υγρού)
Ευχαριστώ για την διευκρίνιση.